最早上报疫情的她怎样发现这种不一样的肺炎

她很忙,接受采访的时间一拖再拖,只是叫记者“等通知”。

她叫张继先,湖北省中西医结合医院呼吸与重症医学科主任,54岁,个头不足1米6,话语轻柔,一双疲惫的眼睛透出和善。然而,就是这位温和的女医生,在去年12月最早发现这场疫情的苗头,并和院方一起上报。

当前,基因测序的工作重心已经从序列读取转向数据处理,基因数据分析和解读是关系到基因测序发展和精准医疗应用的关键环节。但是,目前基因测序的数据分析也存在很多难点,例如:算力无法弹性匹配、主机运行效率难以提升、海量数据存储共享实现困难等,在一定程度上阻碍了临床应用的发展。

医院处处小心,因陋就简地把防护做到可能做到的极致。从最初收治那一批病人到1月30日接受记者采访时为止,张继先所在的科室做到了无一例医护人员感染,无病人交叉感染。

煤炭、钢材和有色金属价格稳中有降。2月份,煤炭供需基本平衡,价格环比由上月下降0.6%转为持平;受钢材库存增加影响,黑色金属冶炼和压延加工业价格环比下降1.4%,降幅比上月扩大0.8个百分点;受国际铜价不断走低影响,铜冶炼价格下降3.6%,拉动有色金属冶炼和压延加工业价格由上月上涨0.6%转为下降1.5%。

非生活必需品价格基本稳定。赵茂宏分析说,2月份因疫情防控,部分商业和服务网点停止营业,一些非生活必需品消费需求也受到抑制,供需均有收缩,价格基本稳定,部分项目价格甚至出现下降。

华大基因科技服务测序过很多复杂基因组,单一规格的计算资源无法满足业务需求,云计算提供的可供灵活选择的计算资源是最好的选择。

2019年12月29日下午1点,分管院长夏文广召集了呼吸科、院感办、心血管、ICU、放射、药学、临床检验、感染、医务部的10名专家,大家对这7个病例进行了逐一讨论。影像学特殊、全身症状明显,实验室检查发现肌酶、肝酶都有变化,专家们一致认为,这种情况确实不正常,要引起高度重视。

对于基因测序行业来说,有着最好的发展机遇,但也面临着巨大的挑战,这个挑战就是如何做到测序更快、分析更快,更重要的是技术创新更快,通过结合云技术、人工智能、5G等新技术将为行业带来了全新动力。只有这样,企业才能在竞争中脱颖而出,整个行业也才能适应精准医疗的发展速度,以科技造福未来。

在收治那一家三口住院时,张继先在呼吸科病房隔出一块与其他区域相对独立的地方,建立了有9张病床的隔离病房。

傍晚,武汉市传染病定点收治医院——武汉市金银潭医院业务副院长黄朝林和ICU主任吴文娟来到湖北省中西医结合医院,逐一查看了这7个病人,接走了6位病人,其中轻症三位、重症三位,那一家三口的儿子坚决不去金银潭医院,留在张继先这里继续治疗,今年1月7日病愈出院。

交通银行金融研究中心高级研究员刘学智表示,在疫情防控期间,市场供给和流通在一段时间内受到了限制,导致食品价格同比涨幅扩大,支撑了CPI同比处于高位。不过,非食品价格和核心CPI明显回落,反映出整体需求偏弱,后续物价上涨压力并不大。

张继先正在穿戴防护服和眼镜,准备进入病房

张继先正在查看病人的肺部CT影像

张继先让老两口叫来他们的儿子做检查,儿子没有任何症状,但CT一照,肺上也有那种表现了。

赵茂宏分析说,食品价格上涨主要受供需两方面影响。从供给方面看,各地不同程度地实施了交通运输管控措施,部分地区物流不畅;人力短缺造成物资配送难度加大,成本有所上升;部分企业和市场延期开工开市,一些产品生产和供给受到影响,难以及时满足市场需要。从需求方面看,受“居家”要求与“避险”心理等因素影响,有的居民出现囤购行为,部分地区出现抢购方便面、肉制品和速冻食品等易储食品现象,甚至波及其他食品,助推价格上涨。

在基因检测领域,对于采集的基因样本进行数据分析和处理需要大量的计算资源。基因测序公司需要庞大的算力支持;生命科学的研究竞赛,很多时候已经变成了一场算力的比拼,大的科研成果通常是基于庞大的数据。现在的产前检测、肿瘤检测等医疗检测也会消耗大量的算力。以上这些基因测序对算力的需求都是波动的,往往Q4的消耗最大而Q1最少,同时对于不同生物的基因组,需要的算力也不同,这就会牵扯到计算集群的扩缩容,传统的线下计算集群是做不到快速的扩缩容的,这就是使用云计算的便利性。

“一般来说,一家来看病,只会有一个病人,不会三口同时得一样的病,除非是传染病。”张继先给这些病人做了甲流、乙流、合胞病毒、腺病毒、鼻病毒、衣原体、支原体等与流感相关的检查,病人全部呈阴性,从而排除了流感。

接受完短暂的采访,张继先又一头扎进病房,那里是容不得她一丝马虎的战场,只留下一个匆匆的背影

“从目前形势看,国际原油价格大概率会呈现‘箱体震荡、波动率增大’,波动中枢会比去年有所下降。”郭丽岩表示,国际原油价格会通过石油石化产业链相关原材料价格影响国内PPI波动趋势,但原油价格波动向下游传导有一定滞后性且传导幅度会打折扣,对PPI的拉跌幅度还有待观察。总的来说,油价下跌有利于降低经济社会总体运行成本,CPI篮子中交通运输项价格走低短期内有利于对冲食品涨价影响。

“由于全球需求低迷叠加新冠肺炎疫情全球蔓延,原油等大宗商品价格下滑,拖累PPI回落。”周茂华说。

她判断“这肯定有问题”

追问到还有两例类似病史患者,到同济医院、协和医院去治疗,留下来的地址也是华南海鲜市场后,夏文广副院长立即决定:直接向省、市卫健委的疾控处报告。

现阶段,基因测序的应用还是主要集中在无创产前检测和肿瘤诊断治疗两个领域,在临床方面并未广泛应用,随着应用的更加广泛,对密集计算和海量数据处理能力也有更高的要求。

针对基因测序行业,华为云专门为客户定制了多种高度整合的基因测序解决方案。相对行业中传统使用的HPC高性能计算集群,基因容器服务有着明显的领先优势:资源调度更灵活,计算可以按需伸缩,任务流程方便自定义,容器更易维护升级等。

线下集群架构不支持高通量的计算(多任务并行),超算测试过之后也无法解决高通量计算问题(主要问题是测序软件针对云计算的优化)。面对这个问题,华为云利用基因容器技术,对客户常用的软件进行了优化,为华大基因提供了云端基因测序解决方案,支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。

决定称,张定宇、张继先同志在抗击疫情阻击战中表现突出,作出了重大贡献。全省事业单位工作人员特别是奋战在疫情防控一线的事业单位工作人员,要向张定宇、张继先同志学习,学习他们面对疫情挺身而出、冲锋在前的革命精神,学习他们勇于担当、恪尽职守的责任担当,学习他们舍身忘我、无私无畏的爱民情怀,牢记初心使命,增强“四个意识”、坚定“四个自信”、做到“两个维护”,坚定信心、同舟共济,立足岗位、勇于担当,无私奉献、英勇奋战,坚决打赢疫情防控阻击战。

“从PPI看,最近一段时间以来,国际原油价格大幅下跌,石油石化产业链对PPI有一定拉跌影响,但PPI当中的其他原材料价格有涨有跌,需要综合观测。”郭丽岩说。

病人太多,医护人员太苦

云技术在基因测序行业中扮演怎样的角色?

2月6日,湖北省人社厅和省卫健委发布表彰决定,给予武汉市金银潭医院(武汉市传染病医院)党委副书记、院长张定宇同志,湖北省中西医结合医院呼吸内科主任张继先同志记大功奖励。

2月1日,记者多方求证,各方信源均证实是湖北省中西医结合医院最早上报疫情,并评价给政府及早监测疫情争取了时间。

“我从那个时候就建立起相关意识了。”张继先说,医生看病,要问病人的住址、职业,这一下来了4个华南海鲜市场的,怎么会没有问题?“这就是‘非典’时期锻炼出来的思维。”

1月30日,记者当面问起张继先悲伤的原因,她说:“病人太多了,我们的医护人员太苦了!”

张继先在隔离病房中查房

“2月份,部分食品尤其是猪肉和蔬菜对CPI拉动影响明显。”中国宏观经济研究院市场与价格研究所研究员郭丽岩指出,受新冠肺炎疫情影响,猪肉和鲜菜产销受阻,人工和物流成本明显上升,导致春节过后价格不降反升。与1月份相比,2月份CPI同比、环比都有小幅回落,主要由于2月份翘尾因素下降,同时受疫情和油价等影响,非食品价格尤其是服务价格等环比为负、同比增幅收窄。

2月份,CPI同比上涨5.2%,涨幅比上月回落0.2个百分点;环比上涨0.8%,涨幅回落0.6个百分点。前两个月平均,CPI比去年同期上涨5.3%,比去年同期扩大3.7个百分点。

2018年,华为云推出了全球首家基因容器服务GCS(GeneContainer Service),基因容器服务是业界首个基于Kubernetes平台,结合Docker容器技术打造的基因测序云服务,基于轻量级的容器技术,结合大数据、深度学习算法,为测序厂商提供了灵活可定制的测序流程、秒级可伸缩的高可靠资源和便捷一站式用户体验,让基因测序数据的计算更省、更快、更轻松。华大基因使用华为云技术后运行周期大大减少。

2019年12月29日是星期天,省、市卫健委疾控处接到报告后快速反应,指示武汉市疾控中心、金银潭医院和江汉区疾控中心,来到医院,开始流行病学调查。

张定宇、张继先被记大功

专家表示,突如其来的新冠肺炎疫情对价格走势形成了较为复杂的冲击,但随着党中央、国务院一系列复工复产、保供稳价等政策措施的实施,价格运行总体平稳,呈现出有涨有降的结构性变化态势。当前,疫情防控形势持续向好,部分农产品价格略有回落,全年CPI大概率呈现“前高后低”格局。

云计算助力基因测序快速发展和技术创新

通过华为云与华大基因的合作案例,我们可以清晰的看出,华为云可以减少运行周期,提高计算效率和数据储存能力,缩短报告周期,保障海量数据的计算、存储和分析等,带给基因测序行业更多可能,为基因测序行业插上新的翅膀,将算力发挥到极致,可以更快、更多的进行生物信息分析,拓展应用领域,助力精准医疗更快的发展。

7个病人,症状和肺部表现一致,只是轻重有区别。张继先敏锐地意识到情况不对,立即又向医院进行了报告,并建议医院召开多部门会诊。

张继先接受采访时坚定地说,疫情发现越早越有利于控制。“我们现在感觉自己做对了!”

张继先头脑中的疑团越来越大,2019年12月27日,她把这4个人的情况向业务院长夏文广、医院院感办和医务部作了汇报,医院立即上报给江汉区疾控中心。

病人的病号饭要从隔离窗口送进病房

1月26日,湖北省中西医结合医院成为第三批定点医院,收治病人由医院统一安排。病人太多了,必须按轻重缓急来统筹。

与此同时,张继先嘱咐科室人员在网上订购了30套细帆布的白色工作服,2019年12月31日那天,这批被她视为隔离服的工作服寄到了科室。

下半年物价将明显回落

生产领域价格稳中略降

张继先说,对传染病的防护意识生根于“非典”。2003年抗击“非典”时,时年37岁的她是江汉区专家组的成员,每天的任务就是下到各个医院排查疑似者。

消费领域价格继续上涨

这一天,还来了一位华南海鲜市场的商户,一样的发烧、咳嗽,一样的肺部表现。

2019年12月26日上午,医院附近小区的一对老两口因发烧、咳嗽看病,当时两人是自己走来的,拍出来的胸部CT片,却呈现出与其他病毒性肺炎完全不同的改变。

“我这次把一生的眼泪流光了!”这一个月来,睡眠严重不足,体力严重透支,她竭尽了全力。

“尽管CPI仍处于相对高位,但涨幅已经有所回落。”国家统计局城市司司长赵茂宏分析说。

周茂华建议,当前结构性物价不会对逆周期调节政策构成影响,但考验政策的精准与效能。由于国内货币政策需要稳增长、稳物价、稳杠杆、防风险等多个目标取得平衡,政策稳健基调不会变,需要在优化政策信贷结构、提升政策效能等方面下功夫。(记者 林火灿)

光大银行金融市场部分析师周茂华认为,2月份CPI同比涨幅维持在5%以上,主要受猪肉供给缺口与季节性因素影响。2月份CPI同比较1月份回落,主要是蔬菜鲜果、服务等价格回落抵消了猪肉价格上涨,以及受翘尾因素影响。

“疫情对物价形成了短期扰动性冲击,但并没有改变总供给与总需求之间的动态平衡,物价平稳运行态势没有改变,仍以结构性、阶段性、区域性上涨特征为主,不存在全面持续上涨的基础。”郭丽岩说。

来自于“非典”时期的锻炼

以华大基因与华为云的合作为例,双方发挥各自优势,华大基因的核心业务系统迁移上云,堪称是云计算在行业内应用落地、技术真正服务于社会的典范。

张继先的工作证,照片下面印着四个鲜红的字:共产党员

原定采访张继先的时间是1月29日中午,记者出发时,接到医院党委书记邱海芳的电话:“您现在别来了,张继先主任在病房大哭!”

自购的工作服被大家穿到了医生白大褂和护士服的里面。“不管怎么说,我们多穿一层,对自己防护好一点。”这一套厚帆布的“防护服”一直用到今年1月20日,在钟南山院士明确新型冠状病毒感染的肺炎能够人传人后,才完成它的使命。这一天,医院给他们配备了三级防护服。

元旦期间,湖北省中西医结合医院呼吸科的门诊量开始激增,由原来一天100人左右,增加到230人左右,像之前7个人那样的病人越来越多。张继先他们去给其他呼吸道慢性病住院病人做工作,让他们尽快出院,有的病人不愿意出院,医护人员就找各种理由劝说。

2月份,PPI同比下降0.4%,上月为同比上涨0.1%;2月份,环比下降0.5%,上月为环比持平。前两个月平均,PPI同比下降0.2%。

“这次把一生的眼泪流光了”

华为云基因测序解决方案架构/来源:华为云官网

医药制造业价格略有上涨。疫情发生后,医疗防护物资生产企业积极复工复产保障供应,但受原材料价格上涨、物流成本上升等因素影响,2月份医药制造业价格环比上涨0.3%。其中,消毒产品价格上涨14.8%,卫生材料价格上涨1.5%。

湖北省中西医结合医院是离华南海鲜市场最近的两家三级医院之一。那6个病人被金银潭医院接走后,张继先的呼吸科门诊又陆陆续续收治了类似的病人。到元旦时,这9张隔离病床不够用了。

刘学智表示,猪肉价格同比涨幅扩大,是拉动2月份食品价格同比扩大的主要原因。目前,全国平均猪肉批发价已经持续下降,猪肉价格有望逐渐趋稳回落。需求偏弱叠加国际油价大幅回落,预计在国内疫情控制住之后,PPI和CPI涨幅都可能明显回落。这也将为国内宏观政策加大逆周期调节力度释放更大空间。

“随着国内疫情不断好转,复工复产等经济活动有望加快回暖。考虑到全球经济复苏放缓和疫情影响,国际原油等大宗商品价格走低,或将对国内工业品价格上涨形成一定的掣肘。”周茂华分析说。

当前,经过全国上下艰苦努力,已初步呈现疫情防控形势持续向好、生产生活秩序加快恢复态势,部分农产品价格也略有回落。考虑到疫情的影响仍将持续一段时间,预计农产品价格相对高位运行的态势仍将持续一段时间,但全年CPI呈现“前高后低”的概率较大。

华为云携手华大基因助力行业发展

7个相似病人4个来自华南海鲜

云计算正是解决基因检测行业痛点的强大工具,随着5G时代的来临,云计算将在保障海量数据的计算、存储和分析的同时,带给基因测序行业更多可能。

目前的数据缺乏标准化,在很多情况下,即便是同一家医院,由于生物测序设备、软件甚至流程不同,数据形式都会大相径庭。“当我们把这种数据放在一起,会出现系统性的偏差。”业内从业者表示,“标准化所指的不仅是分子数据,也包括患者的个体信息、用药和愈后随访。这些数据信息的统一和一定程度的共享,需要得到解决。”

基因数据量规模不断扩大,大量数据分散在不同的国家、城市、医院,缺乏统一性。这样分散、游离状态的数据不利于大数据指导下的精准医疗研究。数据统合和共享是阻碍基因测序数据临床转化的一个难点。

2019年12月28、29日两天,门诊又陆陆续续收治了3位同样来自华南海鲜市场的病人,这一下就有7个一样的病人了。

周茂华认为,核心CPI连续18个月处于“1”时代,表明内需对物价拉动力温和。一段时间以来,国内及时采取一系列政策措施有效降低疫情影响,有关部门加大节日冻猪肉投放,及时疏通运输物流,加大民生必需品生产供应,打击囤积居奇。目前,猪肉季节性需求因素减弱,蔬菜、水果等随着气温回暖供应更充足,预计后续物价整体呈现稳中趋缓走势,下半年物价将明显回落。

有的病人病情发展太快,手段用尽,还是走了,张继先大哭;有时防护服快没有了,口罩快用完了,张继先大哭……张继先说,这个传染病,从来没有见过;这么多的病人涌向医院,从来没有见过。

赵茂宏分析说,2月份受季节和疫情因素影响,一些工业企业停工停产,需求减弱,全国PPI环比由上月持平转为下降,同比由上涨转为下降。据测算,在2月份0.4%的同比降幅中,去年价格变动的翘尾影响约为0.1个百分点,新涨价影响约为-0.5个百分点。

采访中张继先数次落泪

郭丽岩分析说,预计上半年CPI翘尾较高,叠加疫情冲击,猪肉等部分食品保供稳价压力仍然较大,但下半年翘尾明显下降,且猪肉价格对比基数抬升,猪肉对新涨价的拉动影响将减弱,下半年CPI降幅会比上半年收窄。

把脉基因行业痛点,算力才是关键

从收治那一家三口起,张继先就要求所有的呼吸科医护人员戴口罩。医院给他们科室批了N95专业防护口罩,“我们只有进入那个区域才戴N95,其他区域还是一般医用口罩。”

痛哭一场,她又一头扎进病房,那里是容不得她一丝马虎的战场。

“这是我们从来没有见到过的病,同样来自华南海鲜市场的有4个病人了,这肯定有问题”,张继先判断。